| Qualifikation | 1.Runde | Achtelfinale | |
| Viertelfinale | Halbfinale | ||
| Finale | |||
| Qualifikation | ||
| AEL Limassol FC - Dunajska Streda | 0:1 | 1:5 |
| zurück | ||
| 1.Runde | ||
| Avenir Beggen - Hamburger SV | 0:5 | 0:3 |
| 1. FC Lokomotive Leipzig - Olympique Marseille | 0:0 | 0:1 |
| KV Mechelen - FC Dinamo Bukarest | 1:0 | 2:0 |
| Aalborg BK - NK Hajduk Split | 1:0 | 0:1n.V. 2:4i.E. |
| FC Ajax Amsterdam - FC Dundalk | 4:0 | 2:0 |
| Real San Sebastian - Slask Breslau | 0:0 | 2:0 |
| Sporting CP Lissabon - FC Tirol | 4:0 | 2:4 |
| FK Dinamo Minsk - Genclerbirligi SK | 2:0 | 2:1 |
| Rovaniemi PS - FC Glentoran | 0:0 | 1:1 |
| Vlaznia Shkodra - FC Sliema Wanderers | 2:0 | 4:0 |
| Dunajska Streda - Young Boys Bern | 2:1 | 1:3 |
| IA Akranes - Kalmar FF | 0:0 | 0:1n.V. |
| FK Vitoscha Sofia - Iraklion Kreta | 1:0 | 1:3 |
| SC Ujpest Dosza Budapest - FC Den Haag | 1:0 | 1:3 |
| FC St. Mirren - Tromsö IL | 1:0 | 0:0 |
| Merthyr Tydfil - Atalanta Bergamo | 2:1 | 0:2 |
| zurück | ||
| Achtelfinale | ||
| Hamburger SV - FC Ajax Amsterdam | 0:1 | 0:2 |
| Vlaznia Shkodra - Rovaniemi PS | 0:1 | 0:1 |
| Iraklion Kreta - Atalanta Bergamo | 1:0 | 0:2 |
| FC Den Haag - Young Boys Bern | 2:1 | 0:1 |
| Real San Sebastian - FK Dinamo Minsk | 1:1 | 0:0 |
| Kalmar FF - Sporting CP Lissabon | 1:0 | 0:5 |
| KV Mechelen - FC St. Mirren | 0:0 | 2:0 |
| Olympique Marseille - NK Hajduk Split | 4:0 | 0:2 |
| zurück | ||
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| Viertelfinale | ||
| KV Mechelen - FK Dinamo Minsk | 1:0 | 1:1 |
| Atalanta Bergamo - Sporting CP Lissabon | 2:0 | 1:1 |
| Young Boys Bern - FC Ajax Amsterdam | 0:1 | 0:1 |
| Rovaniemi PS - Olympique Marseille | 0:1 | 0:3 |
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| Halbfinale | ||
| KV Mechelen - Atalanta Bergamo | 2:1 | 2:1 |
| Olympique Marseille - FC Ajax Amsterdam | 0:3 | 2:1 |
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| Finale am 11.05.1988 in Straßburg | ||
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KV Mechelen - FC Ajax Amsterdam |
1:0 | |